Выплата законна. А вот что вы техпаспорт не переделали  это уже другой вопрос. Так даже если это и грузовой автомобиль, что водителю не положена надбавка.

Оплачиваете согласно закона только 40 дней за год.

КЕКВ 2240

Посмотрите по балансу числились ли у вас эти деревья. Если числились оформите акт и спешите. А если нет то ничего делать не надо.

Сделайте ей расчет по количеству дней положенного ежегодного отпуска, если у нее эти дни остались. Обычно перед декретом забирают все положенные отпуска. Поскольку зарплаты за последние 12 месяцев у нее нет, в расчет берется оклад согласно штатного расписания на той должности где она числилась.

К сожалению с декабря месяца уже и от фиксированной индексации отнимается повышение.